Всестороннее давление на Православную Церковь Молдовы связано с существованием, развитием и поддержкой церковного раскола в стране.
Так называемая Бессарабская митрополия, хотя и пользуется всеми правами юридического лица после проигрыша молдавским государством в 2001 г. иска в Европейском суде по правам человека, продолжает оставаться тем, чем была с момента своего появления в 1992 г. – организацией раскольников, нарушивших священническую присягу и церковные законы (каноны) при переходе из Русской Православной Церкви в Румынскую. Тот факт, что Румынская Православная Церковь приняла этих раскольников в свой состав путем якобы «воссоздания» исторической Бессарабской митрополии (существовала в 1925-1940 и в 1941-1944 гг.) сути проблемы не меняет.
Демонстративно поддерживая «Бессарабскую митрополию», власть Молдовы пытается оказать давление на каноническую Церковь в лице Митрополии Кишинева и всея Молдовы.
Для ПЦМ наиболее сложным в этом отношении был 2023 г., именно тогда возросло давление на митрополита Владимира (Кантаряна), предстоятеля Православной Церкви Молдовы, с целью принудить его пойти на разрыв с Московским Патриархатом. Были задействованы различные средства: подкуп священников, кампания в СМИ с обвинениями в адрес Патриарха Московского Кирилла, возникла даже инициатива «группы клириков» о переходе «всей Молдавской митрополией» в состав Румынского Патриархата.
И хотя властями ставилась задача оторвать в одночасье как можно больше общин, в течение года лишь 23 прихода из 1347 религиозных общин самовольно и неканонично перешли к раскольникам.
К сожалению, давление на ПЦМ продолжает нарастать. Сторонники "Бессарабской митрополии" пытаются силой захватывать храмы канонической Церкви, а над нею повисла угроза запрета, которую могут реализовать нынешние власти Молдовы.